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1  Solanum tuberosum Group Phureja clone DM1-3     potato doubled monoploid        S_tuberosum_DM  A_albopictus_Jan_2024   AalbF5
2  Chlorocebus sabaeus     African green monkey    C_sabaeus  A_australis_Jun_2015    aptMan1
3  Anguilla rostrata       American eel    A_rostrata  A_californica_Sep_2008  aplCal1
4    A_carolinensis_Feb_2007 anoCar1 Anolis_carolinensis.AnoCar1.0.reference
5    A_carolinensis_May_2010 anoCar2 AnoCar2.0
6    A_chrysaetos_canadensis_Oct_2014        aquChr2
7    A_gambiae_Oct_2006      anoGam3
8    A_gambiae_Feb_2003      anoGam1 Anopheles_Feb_2003      Ag      ag      ag:Feb_2003     Ag:Feb_2003     MOZ2
9    A_lyrata_Apr_2011       Arabidopsis_lyrata_JGI_v1.0
10    A_melanoleuca_Dec_2009  ailMel1 Ailuropoda_melanoleuca.ailMel1.reference        Shenzhen 1.0
11    A_mellifera_Jan_2005    apiMel2
12    A_mellifera_Jul_2004    apiMel1
13    A_mississippiensis_Aug_2012     allMis1
14    A_thaliana_Apr_2008     TAIR8   tair8   Tair8   A_thaliana_TAIR8
15    A_thaliana_Jan_2004     At:NCBIv5       At:NCBI5        at.NCBIv5       at5     NCBIv5  TIGRv5  at:TIGRv5       At:TIGRv5       at:Jan_2004     At:Jan_2004     TAIR7   tair7   Tair7   A_thaliana_TAIR7
16    A_thaliana_Jun_2009     TAIR9   tair9   Tair9   Arabidopsis_thaliana_TAIR10     TAIR10  Arabidopsis_thaliana_TAIR9      araTha1
17    B_floridae_Mar_2006     braFlo1 JGI 1.0
18    B_acutorostrata_Oct_2013        balAcu1
19    B_bison_bison_Oct_2014  bisBis1
20    B_taurus_Aug_2006       bosTau3 Cow_Aug_2006
21    B_taurus_Mar_2005       bosTau2 Cow_Mar_2005
22    B_taurus_Oct_2007       bosTau4 Cow_Oct_2007    Bos_taurus.Btau_4.0.reference
23    B_taurus_Nov_2009       bosTau6 Cow_Nov_2009
24    B_taurus_Oct_2011       bosTau7 Btau_4.6.1
25    B_taurus_Apr_2018       bosTau9
26    C_brenneri_Feb_2008     caePb2  WUGSC 6.0.1
27    C_brenneri_Jan_2007     caePb1
28    C_briggsae_Aug_2005     cb2
29    C_briggsae_Jan_2007     cb3
30    C_briggsae_Jul_2002     cb1
31    C_elegans_Aug_2004      http://www.wormbase.org/genome/C_elegans/WS130  http://www.wormbase.org/genome/C_elegans/WS130/
32    C_elegans_Aug_2007      ce5
33    C_elegans_Jan_2007      C_Elegans_January_2007  ceJan2007       ce4     ce:Jan_2007     Ce:Jan_2007     WS170
34    C_elegans_Feb_2009      ce7     Caenorhabditis_elegans.WS200.reference
35    C_elegans_Jun_2009      ce8     Caenorhabditis_elegans.WS204.reference
36    C_elegans_Mar_2004      C_Elegans_March_2004    ceMar2004       ce2     ce:Mar_2004     Ce:Mar_2004     WS120
37    C_elegans_Mar_2005      ce3
38    C_elegans_May_2003      C_Elegans_May_2003      ceMay2003       ce1     ce:May_2003     Ce:May_2003
39    C_elegans_May_2008      C_Elegans_May_2008      ceMay2008       ce6     ce:May_2008     Ce:May_2008     WS190
40    C_elegans_Oct_2010      ce10    WS220
41    C_elegans_Feb_2013      ce11
42    C_familiaris_Jul_2003   canFam1
43    C_familiaris_May_2005   canFam2 Dog_May_2005    Canis_familiaris.BROADD2.reference
44    C_familiaris_Sep_2011   canFam3 CanFam3.1
45    C_familiaris_Mar_2020   canFam4
46    C_familiaris_May_2019   canFam5
47    C_griseus_Jun_2017      criGriChoV2
48    C_griseus_Aug_2011      criGriChoV1
49    C_griseus_Jul_2013      criGri1
50    C_hoffmanni_Jul_2008    choHof1
51    C_hoffmanni_Sep_2008    Choloepus_hoffmanni.choHof1.reference
52    C_intestinalis_Dec_2002 ci1     Ciona_intestinalis.JGI1.reference
53    C_intestinalis_Mar_2005 ci2     Ciona_intestinalis.JGI2.reference
54    C_intestinalis_Apr_2011 ci3
55    C_jacchus_Jun_2007      calJac1
56    C_jacchus_Mar_2009      calJac3 Callithrix_jacchus.calJac3.reference    WUGSC 3.2
57    C_jacchus_May_2020      calJac4
58    C_japonica_Jan_2009     caeJap2
59    C_japonica_Mar_2008     caeJap1 WUGSC 3.0.2
60    C_milii_Dec_2013        calMil1
61    C_porcellus_Feb_2008    cavPor3 Cavia_porcellus.cavPor3.reference
62    C_picta_Dec_2011        chrPic1
63    C_remanei_Mar_2005      caeRem1
64    C_remanei_Mar_2006      caeRem2
65    C_remanei_May_2007      caeRem3 WUGSC 15.0.1
66    C_sabaeus_Mar_2014      chlSab2
67    C_savignyi_Jul_2005     cioSav2 Ciona_savignyi.CSAV2.reference  Ciona_savignyi.CSAV2.0.reference
68    C_savignyi_Apr_2003     cioSav1
69    C_simum_May_2012        cerSim1
70    C_teleta_Jan_2013       Capca1
71    D_ananassae_Aug_2005    droAna2
72    D_ananassae_Jul_2004    droAna1
73    D_dama_Nov_2023 ASM3311817v1
74    D_erecta_Aug_2005       droEre1
75    D_grimshawi_Aug_2005    droGri1
76  D_magna_Apr_2010        Daphnia magna Xinb3 v2.4  D_magna_Apr_2010        Daphnia magna Xinb3 v2.4
77  D_magna_Jan_2019        Daphnia magna SK v1.0  D_magna_Jan_2019        Daphnia magna SK v1.0
78    D_melanogaster_Aug_2014 dm6
79    D_melanogaster_Apr_2004 Drosophila_Apr_2004     BDGP Release 4  dm2     dm:Apr_2004     Dm:Apr_2004     Dm:R4   Dm:BDGPv4       Dm;BDGPv4       Dm:BDGPv4h      Dm;BDGPv4h
80    D_melanogaster_Apr_2006 Drosophila_Apr_2006     BDGP Release 5  dm3     dm:Apr_2006     Dm:Apr_2006     Dm:R5   Dm:BDGPv5       Dm;BDGPv5       Dm:BDGPv5h      Dm;BDGPv5h
81    D_melanogaster_Jan_2003 Drosophila_Jan_2003     Drosophila jan2003      dm1     dm:Jan_2003     Dm:Jan_2003     Dm:R3   Dm:BDGPv3       Dm;BDGPv3
82    D_mojavensis_Aug_2004   droMoj1
83    D_mojavensis_Aug_2005   droMoj2
84    D_novemcinctus_Jul_2008 dasNov2 Dasypus_novemcinctus.dasNov2.reference
85    D_novemcinctus_Dec_2011 dasNov3
86    D_ordii_Jul_2008        dipOrd1 Dipodomys_ordii.dipOrd1.reference
87    D_persimilis_Oct_2005   droPer1
88    D_pseudoobscura_Nov_2004        dp3
89    D_pseudoobscura_Aug_2003        dp2
90  D_pulex_Feb_2011        Daphnia pulex TCO v1.0  D_pulex_Feb_2011        Daphnia pulex TCO v1.0
91  D_pulex_Sep_2016        Daphnia pulex PA42 v3.0  D_pulex_Sep_2016        Daphnia pulex PA42 v3.0
92  H_sapiens_Dec_2013      grcH38P12       GRCh38.p12  D_rerio_May_2017        danRer11
93    D_rerio_Sep_2014        danRer10
94    D_rerio_Jul_2010        danRer7
95    D_rerio_Dec_2008        danRer6 Zv8     Zebrafish_Dec_2008      Danio_rerio.Zv8.reference
96    D_rerio_Jul_2007        danRer5 Zv7     Zebrafish_Jul_2007
97    D_rerio_Mar_2006        danRer4 Zv6     Zebrafish_Mar_2006
98    D_rerio_May_2005        danRer3 Zv5     Zebrafish_May_2005
99    D_sechellia_Oct_2005    droSec1
100    D_simulans_Apr_2005     droSim1
101    D_virilis_Aug_2005      droVir2
102    D_virilis_Jul_2004      droVir1
103    D_yakuba_Apr_2004       droYak1
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106    E_caballus_Jan_2007     equCab1
107    E_caballus_Sep_2007     equCab2 Equus_caballus.EquCab2.reference
108    E_caballus_Jan_2018     equCab3
109    E_coli_K12-MG1655_Jan_2012      E_coli_K12_Jan_2012     E. coli eschColi_K12
110    E_europaeus_Jun_2006    eriEur1
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113    E_telfairi_Jul_2005     echTel1
114    E_telfairi_Nov_2012     echTel2
115    F_catus_Mar_2006        felCat3
116    F_catus_Dec_2008        felCat4 felCatV17e
117    F_catus_Sep_2011        felCat5
118    F_catus_Nov_2014        felCat8
119    F_catus_Nov_2017        felCat9
120    F_vesca_Sep_2011        Fragaria_vesca_JGI_v1.1
121    G_aculeatus_Feb_2006    gasAcu1 Gasterosteus_aculeatus.BROADS1.reference
122    G_fortis_Apr_2012       geoFor1 GeoFor_1.0
123    G_gallus_Mar_2018       galGal6
124    G_gallus_Dec_2015       galGal5
125    G_gallus_Nov_2011       galGal4 Gallus_gallus-4.0      
126    G_gallus_Feb_2004       galGal2
127    G_gallus_May_2006       galGal3 Chicken_May_2006        Gallus_gallus.WASHUC2.reference
128    G_gorilla_Aug_2019      gorGor6
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130    G_gorilla_Dec_2014      gorGor4
131    G_gorilla_May_2011      gorGor3 Gorilla_gorilla.gorGor3.reference       gorGor3.1
132    G_gorilla_Aug_2009      gorGor2
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134    G_max_Dec_2008  Glyma1  Soybean_Dec_2008        JGI_Soybean_v101
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136    G_variegatus_Jun_2014   galVar1
137  H_exemplaris_Z151_Apr_2017      nHd_3.1  H_exemplaris_Z151_Apr_2017      nHd_3.1
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139    H_glaber_Jan_2012       hetGla2
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141    H_sapiens_Apr_2003      H_sapiens_Apr_2003_Encode       Human_Apr_2003  Human 10apr2003 Human_10apr2003 hs.NCBIv33      hg15    human_ncbi33    ncbi.v33        Human_Apr_2003_Encode   hs:Apr_2003     Hs:Apr_2003     hs:NCBIv33      Hs:NCBIv33      Hs;NCBIv33      Hs:NCBI33
142    H_sapiens_Dec_2001      Human_Dec_2001  Human 22dec2001 Human_22dec2001 hs.NCBIv28      hg10    human_ncbi28    ncbi.v28        hs:Dec_2001     Hs:Dec_2001     hs:NCBIv28      Hs:NCBIv28      Hs;NCBIv28      Hs:NCBI28
143    H_sapiens_Feb_2009      Human_Feb_2009  hs.NCBIv37      hg19    human_ncbi37    ncbi.v37        hs:Feb_2009     Hs:Feb_2009     hs:NCBIv37      Hs:NCBIv37      chado/chado-Hsa-19      human/19        Hs;NCBIv37      Hs:NCBI37       GRCh37  Hs:GRCh37       Homo_sapiens.GRCh37.reference
144    H_sapiens_Dec_2013      Human_Dec_2013  hs.NCBIv38      hg38    human_ncbi38    ncbi.v38        hs:Dec_2013     Hs:Dec_2013     hs:NCBIv38      Hs:NCBIv38      chado/chado-Hsa-38      human/38        Hs;NCBIv38      Hs:NCBI38       GRCh38  Hs:GRCh38       Homo_sapiens.GRCh38.reference   grcH38P12       GRCh38.p12
145    H_sapiens_T2T_Jan_2022  hs1     T2T-CHM13 v2.0/hs1
146    H_sapiens_Jul_2003      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/H_sapiens/B34.1      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/H_sapiens/B34.1/
147    H_sapiens_Jul_2003      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/H_sapiens/B34.2      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/H_sapiens/B34.2/
148    H_sapiens_Jul_2003      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/H_sapiens/B34.3      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/H_sapiens/B34.3/
149    H_sapiens_Jul_2003      Human_Jul_2003  hs.NCBIv34      hg16    human_ncbi34    ncbi.v34        hs:Jul_2003     Hs:Jul_2003     hs:NCBIv34      Hs:NCBIv34      human/16        Hs;NCBIv34      Hs:NCBI34
150    H_sapiens_Jun_2002      H_sapiens_Jun_2002_Chr21+22     Human_Jun_2002  Human 28jun2002 Human_28jun2002 hs.NCBIv30      hg12    human_ncbi30    ncbi.v30        Human_Jun_2002_Chr21+22 hs:Jun_2002     Hs:Jun_2002     hs:NCBI30       Hs:NCBIv30      Hs;NCBIv30      Hs:NCBI30
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152    H_sapiens_Mar_2006      Human_Mar_2006  hs.NCBIv36      hg18    human_ncbi36    ncbi.v36        hs:Mar_2006     Hs:Mar_2006     hs:NCBIv36      Hs:NCBIv36      chado/chado-Hsa-18      human/18        Hs;NCBIv36      Hs:NCBI36       Hsa     ensembl2034
153    H_sapiens_May_2004      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/H_sapiens/B35.1      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/H_sapiens/B35.1/
154    H_sapiens_May_2004      Human_May_2004  hs.NCBIv35      hg17    human_ncbi35    ncbi.v35        hs:May_2004     Hs:May_2004     hs:NCBIv35      Hs:NCBIv35      ensembl1834     chado/chado-Hsa-17      human/17        Hs;NCBIv35      Hs:NCBI35
155    H_sapiens_Nov_2002      Human_Nov_2002  Human 14nov2002 Human_14nov2002 hs.NCBIv31      hg13    human_ncbi31    ncbi.v31        hs.exon.2       hs:Nov_2002     Hs:Nov_2002     hs:NCBIv31      Hs:NCBIv31      Hs;NCBIv31      Hs:NCBI31
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157    HuEx-1_0-st-Transcripts HuEx-1_0-st-v2-Transcripts      huex-1_0-st-transcripts huex-1_0-st-v2-transcripts      affy/HuEx-1_0-st-Transcripts    affy/HuEx-1_0-st-v2-Transcripts affy/huex-1_0-st-transcripts    affy/huex-1_0-st-v2-transcripts
158    HuGene-1_0-st-Probes    HuGene-1_0-st-v1        HuGene-1_0-st   HuGene-1_0-st-v1-Probes hugene-1_0-st-probes    hugene-1_0-st-v1-probes affy/hugene-1_0-st-v1-probes    affy/hugene-1_0-st-probes
159    HuGene-1_0-st-Transcripts       HuGene-1_0-st-v1-Transcripts    hugene-1_0-st-transcripts       hugene-1_0-st-v1-transcripts    affy/hugene-1_0-st-transcripts  affy/hugene-1_0-st-v1-transcripts
160    H_vulgaris_Feb_2022     HydraT2T_AEP
161    L_africana_Jul_2009     loxAfr3 Loxodonta_africana.loxAfr3.reference
162    L_africana_Jul_2008     loxAfr2
163    L_africana_May_2005     loxAfr1
164    L_chalumnae_Aug_2011    latCha1
165    L_passim_Apr_2014       C_mellificae_Apr_2014   Crithidia_mellificae    C_mellificae
166    M_acuminata_DH_Pahang_Jan_2016  M_acuminata_DH_Pahang
167    M_domestica_metatherian_Oct_2006        monDom5
168    M_domestica_metatherian_Jan_2006        monDom4
169    M_domestica_metatherian_Oct_2004        monDom1
170    M_eugenii_Sep_2009      macEug2
171    M_fascicularis_Jun_2013 macFas5
172    M_gallopavo_Dec_2009    melGal1
173    M_gallopavo_Nov_2014    melGal5
174    M_murinus_Jun_2003      micMur1 Microcebus_murinus.micMur1.reference
175    M_murinus_May_2015      micMur2
176    M_mulatta_Jan_2006      Rhesus_Jan_2006 Macaque_Jan_2006        Rhesus_macaque_Jan_2006 rheMac2 Baylor Mmul_051212 v.1.0        Macaca_mulatta.MMUL_1.reference
177    M_mulatta_Oct_2010      rheMac3
178    M_mulatta_Nov_2015      rheMac8
179    M_mulatta_Feb_2019      rheMac10
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181    M_musculus_Dec_2011     mm10    GRCm38
182    M_musculus_Jul_2007     Mm:NCBIv37      Mm:NCBI37       mm9
183    M_musculus_Mar_2006     Mouse_Mar_2006
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185    M_musculus_Feb_2006     Mm:NCBIv36      Mm:NCBI36       mm8
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